在醫藥領域，支付寶此前已經與20多家藥店連鎖品牌達成移動支付合作，現在支付寶直接和藥房系統供應商中軟國際達成合作，將支付寶手機支付接入藥房ERP系統，屆時消費者在藥房購買藥品結賬時，只需用支付寶錢包即可完成支付，具體支付方式可能是聲波、條碼或者二維碼。首批試點將覆蓋超過7萬家藥房。
據了解，中軟國際是一家綜合性軟件與信息服務商。在醫藥流通領域，中軟國際與中信21世紀合作，推出了中國藥品電子監管平臺藥監數據上報解決方案，該方案與藥房ERP是打通的，使得藥房銷售藥品時一次性完成藥監數據的上報，以及藥房ERP系統的數據更新（以往，藥品銷售不僅要掃藥監碼，還要掃商品碼）。
支付寶手機支付集成到上述系統，這樣支付寶就可以進入使用中軟國際系統方案的數十萬家藥房。值得注意的是，與中軟國際合作的中信21世紀是阿里巴巴的控股公司。今年一月，阿里巴巴集團聯手云鋒基金，以約13.27億港元認購中信21世紀配售的44.23億股股份，交易完成后阿里巴巴集團持股38.1%，處于控股地位。
支付寶方面還透露，以后還會將藥房的服務納入整個“未來醫院”計劃之中，根據醫藥分離、電子處方等醫改政策的推進，推出醫藥就近配送、慢性病定期送藥等服務。此外，線下藥房與天貓醫藥館未來也會互相打通，用戶在線上下單后，線下藥房可就近配送。所有醫藥零售企業均可加入支付寶的“未來醫院”計劃。
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