在某些方面，Nano Server非常適合虛擬環境。微軟Nano Server尺寸很小，這意味著其能夠高效使用虛擬服務器所使用的物理硬件資源。毫無疑問這會增加主機服務器潛在的虛擬機密度而且可能會提升虛擬機性能。然而與此同時，虛擬化管理員可能必須重新考慮他們管理虛擬機的方式。
采用Nano Server通常不會有太多壓力，因為企業級企業已經徹底改變了他們管理虛擬機的方式。與之相反，開始使用Nano Server的小型企業將不得不過渡到使用大型企業所使用的虛擬機管理模式。主要的原因有兩個：
企業充分使用Nano Server的首要結果可能是Nano Server數量超過了之前被使用的虛擬機總數。其次，Nano Server沒有服務器控制臺。
Nano Server不同于常規的Windows服務器部署。據微軟所說，每個Nano Server應該被配置為執行一個非常明確的任務。因此，你可能從不會擁有一臺多功能的Nano Server。一臺Nano Server意味著只執行一個任務。
當然，這引發的問題就是如何配置應用服務器，因為某些應用存在大量的依賴關系。例如SharePoint依賴于SQL Server、IIS以及.NET Framework。
Nano Server并不是要取代企業中的所有虛擬機。Nano Server主要是被用作基礎設施服務器（DNS、DHCP等等）。應用程序無法運行在Nano Server上（至少目前是這樣）。
問題在于企業可能保存了大量硬件資源，因此只要有可能，就可以通過轉變為Nano Server降低硬件成本。最終的結果將是混合使用Nano Server以及運行更為傳統Windows服務器的虛擬機。然而，該模式幾乎肯定會增加必須要被管理的虛擬機數量。
企業級企業通常管理數以千計的虛擬機而且非常擅長這么做。盡管小型企業突然發現他們要管理數以千計的虛擬機不太可能，但他們可以通過了解大型企業所使用的虛擬機管理技術學到很多知識。
大型企業所使用的眾多管理技術將會變得更加重要，因為Nano Server沒有服務器控制臺。
首先，服務器沒有一個控制臺的觀點可能并非與當前完全不同。畢竟，在微軟引入服務器核心部署概念時，經常提到的就是核心服務器沒有控制臺。然而，存在一個很大的不同就是服務器核心部署有一個冒充的控制臺。例如，這些服務器可能提供一個命令行界面。Nano Server沒有命令行界面，如果你打開微軟Nano Server 虛擬機的控制臺，將會看到一個有一個閃爍光標的黑屏。至少預覽版是這樣的。
在小型企業中，很容易習慣于打開VM Manager或者VMware vCenter管理虛擬機，打開服務器控制臺然后執行需要執行的任務。企業級企業不會這么做。虛擬機數量太多，無法手動管理。大型企業在很大程度上依賴于批量管理技術。
采用Nano Server將會強迫小型企業采用類似于企業環境中所使用的虛擬機批量管理技術。即使這些小型企業不會看到虛擬機數量大量增加，但缺少服務器控制臺將使得人工管理幾乎變得不可能。微軟Nano Server管理員除采用批量管理技術外沒有任何選擇。
Nano Server通過減少虛擬機使用的硬件資源，有可能會降低服務器虛擬化成本。然而，Nano Server與傳統的Windows服務器部署存在明顯的不同之處，因此將會強制小型企業采用虛擬機批量管理技術。
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