據(jù)國(guó)外媒體的報(bào)道，谷歌最近正在通過(guò)一個(gè)名為“Google Genomics”的項(xiàng)目與醫(yī)院和大學(xué)實(shí)驗(yàn)室展開(kāi)合作，共同推進(jìn)人類基因組的存儲(chǔ)、對(duì)比和分析工作。

Google Genomics是谷歌在去年3月推出的一項(xiàng)云端服務(wù)，但隨后由于沒(méi)有進(jìn)行大規(guī)模的推廣而并未引起人們的注意，該項(xiàng)目皆在幫助大學(xué)實(shí)驗(yàn)室和醫(yī)院將患者或科研對(duì)象的生物基因儲(chǔ)存到云端上，服務(wù)的目標(biāo)是“探討遺傳變異交互”，意味著科研專家能夠訪問(wèn)數(shù)百萬(wàn)的生物基因組數(shù)據(jù)，并能輕松簡(jiǎn)單的進(jìn)行對(duì)比和分析。除了谷歌之外，人類基因組數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)目前還已經(jīng)引起了亞馬遜、IBM和微軟等科技巨頭的注意。

谷歌自Google Genomics項(xiàng)目啟動(dòng)以來(lái)，已經(jīng)與多位科學(xué)家進(jìn)行了面談并專門為此開(kāi)放了一個(gè)API接口，方便這些科學(xué)家將DNA數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)移到谷歌的服務(wù)器群上，而科學(xué)家則可以使用這個(gè)囊括了數(shù)十億互聯(lián)網(wǎng)用戶和網(wǎng)頁(yè)索引的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。

“生物學(xué)家們可以通過(guò)我們的服務(wù)來(lái)從對(duì)一個(gè)基因組的研究升級(jí)到對(duì)數(shù)百萬(wàn)個(gè)基因組進(jìn)行研究，”主管Google Genomics項(xiàng)目研發(fā)的軟件工程師大衛(wèi)·格雷澤（David Glazer）說(shuō)道，“我們希望通過(guò)我們的數(shù)據(jù)技術(shù)來(lái)幫助他們實(shí)現(xiàn)質(zhì)的突破。”

盡管有些科學(xué)家認(rèn)為谷歌的服務(wù)對(duì)于復(fù)雜的基因組數(shù)據(jù)來(lái)說(shuō)不過(guò)是杯水車薪，但還是有不少科學(xué)家對(duì)此進(jìn)行了肯定，比如斯坦福大學(xué)的教授阿圖爾·巴特（Atul Butte）在今年對(duì)谷歌的這一計(jì)劃進(jìn)行詳細(xì)了解之后，就表示“這感覺(jué)就像是傳統(tǒng)旅行社在看到Expedia（全球最大的在線旅游公司）一樣”。

科學(xué)家們目前在使用新型設(shè)備在對(duì)DNA進(jìn)行解碼時(shí)所獲得的數(shù)據(jù)越來(lái)越多，速度也越來(lái)越快，如劍橋伯德研究所（Broad Institute in Cambridge）的有關(guān)負(fù)責(zé)人就介紹稱，在今年10月的實(shí)驗(yàn)中，他們每解碼一個(gè)人類基因組需要32分鐘，所產(chǎn)生的原始數(shù)據(jù)高達(dá)200TB。

雖然這種量級(jí)的數(shù)據(jù)流與大型互聯(lián)網(wǎng)公司所處理的數(shù)據(jù)相去甚遠(yuǎn)（伯德研究所兩個(gè)月所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)與YouTube上一天的數(shù)據(jù)上傳量相仿），但卻遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)了任何一位生物學(xué)家的處理能力。就目前情況而言，此類數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)和訪問(wèn)通常通過(guò)大型的商業(yè)數(shù)據(jù)中心來(lái)實(shí)現(xiàn)。美國(guó)國(guó)家癌癥研究所在上月曾表示將耗資1900萬(wàn)美元將大小為2.6PB的癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)的副本存儲(chǔ)到云端，這些涉及數(shù)千名癌癥患者的數(shù)據(jù)的副本未來(lái)也將會(huì)存儲(chǔ)到谷歌Google Genomics項(xiàng)目和亞馬遜的數(shù)據(jù)中心。

西雅圖系統(tǒng)生物學(xué)研究所（Institute for Systems Biology）的科學(xué)家希拉·雷諾茲（Sheila Reynolds）指出，他們希望創(chuàng)建一個(gè)“癌癥基因組數(shù)據(jù)云”，讓科學(xué)家們可以像使用傳統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)搜索那樣簡(jiǎn)便地分享信息和進(jìn)行虛擬實(shí)驗(yàn)，“畢竟并不是每個(gè)人都擁有處理PB級(jí)數(shù)據(jù)的能力的，”她說(shuō)道。

谷歌和亞馬遜已經(jīng)就DNA數(shù)據(jù)向云端轉(zhuǎn)移的費(fèi)用進(jìn)行了為期一年的價(jià)格戰(zhàn)。谷歌表示每個(gè)基因組的年存儲(chǔ)費(fèi)為25美元，而計(jì)算這些數(shù)據(jù)還需要支付額外的費(fèi)用。目前一個(gè)人類基因組在解碼之后的原始數(shù)據(jù)大小在100GB左右，不過(guò)該數(shù)據(jù)還可以被精簡(jiǎn)至1GB以下，谷歌對(duì)此類數(shù)據(jù)的云端儲(chǔ)存價(jià)為每年0.25美元。

云存儲(chǔ)服務(wù)在一定程度上推動(dòng)了Tute Genomics、Seven Bridges和NextCode Health等初創(chuàng)企業(yè)的發(fā)展，這些公司均致力于研究能夠幫助醫(yī)院和科學(xué)家檢索基因數(shù)據(jù)的“瀏覽器”服務(wù)。“谷歌和亞馬遜所提供的是后端服務(wù)，他們往往會(huì)鼓勵(lì)我們?cè)谒麄兊脑贫藙?chuàng)建基因組公司，”Seven Bridges的首席執(zhí)行官德尼茲·庫(kù)魯爾（Deniz Kural）介紹道，該公司目前在亞馬遜的云端存儲(chǔ)并管理著1600位研究人員所提供的基因組數(shù)據(jù)。

庫(kù)魯爾指出，未來(lái)一款藥物的研究和應(yīng)用也將會(huì)依賴于在全球“DNA互聯(lián)網(wǎng)”上進(jìn)行數(shù)據(jù)檢索，“根據(jù)我們的預(yù)測(cè)，加入我在未來(lái)身患肺癌，那么醫(yī)生就會(huì)對(duì)我的基因組和腫瘤基因組進(jìn)行測(cè)序，然后將對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫(kù)中的5000萬(wàn)組數(shù)據(jù)進(jìn)行對(duì)比，”他說(shuō)道，“結(jié)果就是能夠在短時(shí)間內(nèi)找到最適合我的藥物。”

根據(jù)谷歌軟件工程師格雷澤的介紹，Google Genomics項(xiàng)目旨在推動(dòng)生物醫(yī)學(xué)研究從“作坊式”向“工業(yè)化規(guī)模生產(chǎn)”發(fā)展，目前他本人也在學(xué)習(xí)遺傳基因方面的知識(shí)，同時(shí)也在聽(tīng)伯德研究所總監(jiān)埃里克·蘭德?tīng)枺‥ric Lander）的《生物學(xué)概述》（Introduction to Biology）課程，此外格雷澤也已經(jīng)將自己的基因組測(cè)序數(shù)據(jù)放在了谷歌的云端。

格雷澤并未談及Google Genomics項(xiàng)目的規(guī)模以及目前為多少客戶提供服務(wù)，只是透露稱目前已經(jīng)有3500組來(lái)自公共項(xiàng)目的基因組存儲(chǔ)在谷歌的服務(wù)器上。同時(shí)他還指出該項(xiàng)目與谷歌在近期大力投入的保健類項(xiàng)目（如谷歌在今年啟動(dòng)的研究如何延長(zhǎng)人類壽命的Calico項(xiàng)目）暫無(wú)關(guān)聯(lián)，“與基因組有關(guān)的就是人們正在逐漸認(rèn)識(shí)到科學(xué)技術(shù)是能夠推動(dòng)并改變生命科學(xué)研究的現(xiàn)狀的，”格雷澤說(shuō)道。

負(fù)責(zé)管理斯坦福大學(xué)內(nèi)最大的遺傳數(shù)據(jù)計(jì)算機(jī)集群的物理學(xué)家索馬里·達(dá)塔（Somalee Datta）表示，由于谷歌和亞馬遜的云存儲(chǔ)服務(wù)在近期都下調(diào)了價(jià)格，其存儲(chǔ)成本已經(jīng)降至與他們的數(shù)據(jù)中心運(yùn)營(yíng)成本相似的水平，“我們認(rèn)為云存儲(chǔ)價(jià)格還是繼續(xù)下降，一直到比較合理的區(qū)間，”達(dá)塔說(shuō)道。

達(dá)塔還介紹說(shuō)，目前一些斯坦福的科學(xué)家已經(jīng)開(kāi)始使用谷歌的BigQuery數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)（格雷澤的團(tuán)隊(duì)已經(jīng)將該系統(tǒng)與基因組數(shù)據(jù)相兼容），該系統(tǒng)最初是為了跟蹤網(wǎng)民活動(dòng)而開(kāi)發(fā)的，但其同樣能夠幫助科學(xué)家們進(jìn)行數(shù)以千計(jì)的大型基因組試驗(yàn)，“有時(shí)候科學(xué)家們會(huì)想要做一些比較瘋狂的事情，那么就需要一定的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和分析處理能力，”達(dá)塔說(shuō)道，“而谷歌目前就能夠提供這種能力，所以我認(rèn)為這是一種正確的技術(shù)發(fā)展方向，也是值得整個(gè)科研界為之肯定和鼓勵(lì)的。”