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科學數據庫系統平臺建設介紹

責任編輯:企業網 |來源:企業網D1Net  2010-08-06 16:35:20 原創文章 企業網D1Net

科學數據庫系統平臺是一個運用先進信息技術來支撐科學數據庫發展和應用的軟硬件綜合平臺,其總體目標是:在硬件上具有滿足科學數據庫需求的存儲、計算、通信和服務能力,為科學數據庫的持續發展提供保障;在軟件上實現對科學數據庫中大規模、分布式、異構的海量數據資源進行整合,促進科學數據資源的共享;同時支持基于科學數據庫的先進應用系統的開發,推動科學數據在e-Science環境中發揮關鍵作用。

   “系統平臺建設”是“十五”期間中國科學院知識創新工程信息化建設專項中“科學數據庫及其應用系統”重大項目的一個子項目。其主要工作內容包括三個部分:軟硬件環境建設、系統平臺軟件開發、應用系統開發。

    科學數據庫系統平臺軟硬件環境建設與服務

系統平臺軟硬件環境建設對科學數據庫中海量數據資源的保藏、管理、服務和應用具有重大的意義和作用。經過詳細的調研和論證,軟硬件環境的建設方案選擇了以數據中心為主體,由超級數據服務器系統為核心構成的海量數據存儲、處理和服務的環境。軟硬件環境具體包括以下內容:超級數據服務器系統,海量存儲系統,可視化系統,協同工作環境,高速網絡環境,系統軟件等。

超級數據服務器系統由59個4路安騰2處理器的結點構成。海量存儲系統包括20TB磁盤陣列和50TB磁帶庫。可視化系統為20塊LCD(5x4)拼成的顯示墻系統,分辨率達到2600萬像素。協同工作環境包括Access Grid、VRVS等系統。高速網絡環境由高性能千兆局域網構成,對外有2Gbps連接到CSTNET和NSFCNET。

超級數據服務器于2004年10月底基本完成安裝和調試,2005年1月進入試運行,2005年4月開始正式運行并提供服務。20TB磁盤陣列隨超級數據服務器安裝。50TB磁帶庫于2005年6月投入使用。

    科學數據庫系統軟件包括:

操作系統平臺為Windows 2003 Server和Redhat Linux AS 2.1/3;數據庫管理系統有Oracle 9i/10g RAC(2結點8CPU并行),Microsoft SQL Server 2000,MySQL等;機群軟件有聯想機群管理系統、聯想機群監控系統、聯想作業管理系統等;應用軟件有Web服務器Tomcat/apache/Resin/IIS,Java/J2EE,FTP/Rsync等;學科領域軟件有地學GIS軟件(ArcGIS),生物信息處理軟件等。

系統平臺軟硬件環境向科學數據庫建庫單位提供服務,運行良好。結點使用情況為:服務(外部)結點20個,已使用19個;存儲/管理結點9個,全部使用;處理(內部)結點30個,已使用19個。整體結點使用率為79.7%。存儲系統使用情況為:磁盤裸容量20T,RAID容量17T,已分配使用空間14.8T。磁盤陣列使用率為87%。

    數據網格軟件開發與部署

系統平臺的數據網格軟件是針對科學數據庫的特點和需求,利用網格技術,自主開發的一套數據網格中間件和工具集。

以下是最新發布的產品及版本:

· 網格信息服務系統 1.0版

· 通用元數據管理工具 2.0版

· 網格信息與元數據服務(IMS)

· 數據訪問服務(DAS)1.0/1.1/2.0版

· 通用數據訪問工具2.1版

· 科學數據庫CA管理系統 2.0版

· 科學數據庫資源訪問控制工具包1.1版

· 存儲服務1.0版

· 網格門戶

     應用系統

在科學數據庫應用系統方面已經啟動了高能物理領域的“國際宇宙線數據預處理中心”和生物領域的“禽流感等突發疾病綜合信息平臺與預警預報系統”兩個項目。這些應用將在系統平臺軟硬件環境上開發和運行,并充分利用數據網格軟件所提供的支持。禽流感項目由微生物所、武漢病毒所、動物所、網絡中心等4個研究所共同協作完成,在面向e-Science的跨地域、跨學科、跨組織科研協同方面開展了積極的探索和嘗試。

    科學數據庫系統總結

科學數據庫系統平臺的建設過程中,我們還在網格技術等主要技術路線上做了深入的研究,相關研究成果以論文和會議報告的形式發表在國內學術期刊和國內外學術會議上。

在本項目有關工作的基礎上,我們還得到國家有關科技計劃的大力支持:在863計劃中承擔了中國國家網格的應用網格項目“科學數據網格”;在科技部“科學數據共享工程”中承擔了“基礎科學數據中心”項目;在自然科學基金委“以網絡為基礎的科學活動環境”重大研究計劃中承擔了“綜合試驗平臺”的相關課題。

軟硬件環境、系統平臺數據網格軟件都已基本建設開發完成,進入以運行和服務為主的階段,下一步的工作重點是繼續推動建庫單位對系統平臺硬件軟件資源的使用。一方面應加大宣傳推廣力度,讓建庫單位充分了解可用的資源的情況;并提供方便的工具和服務,便于建庫單位使用這些資源。同時,在系統平臺的基礎上進一步推進面向e-Science的科學數據庫應用試點。 

 

 

關鍵字:科學數據庫方案

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科學數據庫系統平臺建設介紹

責任編輯:企業網 |來源:企業網D1Net  2010-08-06 16:35:20 原創文章 企業網D1Net

科學數據庫系統平臺是一個運用先進信息技術來支撐科學數據庫發展和應用的軟硬件綜合平臺,其總體目標是:在硬件上具有滿足科學數據庫需求的存儲、計算、通信和服務能力,為科學數據庫的持續發展提供保障;在軟件上實現對科學數據庫中大規模、分布式、異構的海量數據資源進行整合,促進科學數據資源的共享;同時支持基于科學數據庫的先進應用系統的開發,推動科學數據在e-Science環境中發揮關鍵作用。

   “系統平臺建設”是“十五”期間中國科學院知識創新工程信息化建設專項中“科學數據庫及其應用系統”重大項目的一個子項目。其主要工作內容包括三個部分:軟硬件環境建設、系統平臺軟件開發、應用系統開發。

    科學數據庫系統平臺軟硬件環境建設與服務

系統平臺軟硬件環境建設對科學數據庫中海量數據資源的保藏、管理、服務和應用具有重大的意義和作用。經過詳細的調研和論證,軟硬件環境的建設方案選擇了以數據中心為主體,由超級數據服務器系統為核心構成的海量數據存儲、處理和服務的環境。軟硬件環境具體包括以下內容:超級數據服務器系統,海量存儲系統,可視化系統,協同工作環境,高速網絡環境,系統軟件等。

超級數據服務器系統由59個4路安騰2處理器的結點構成。海量存儲系統包括20TB磁盤陣列和50TB磁帶庫。可視化系統為20塊LCD(5x4)拼成的顯示墻系統,分辨率達到2600萬像素。協同工作環境包括Access Grid、VRVS等系統。高速網絡環境由高性能千兆局域網構成,對外有2Gbps連接到CSTNET和NSFCNET。

超級數據服務器于2004年10月底基本完成安裝和調試,2005年1月進入試運行,2005年4月開始正式運行并提供服務。20TB磁盤陣列隨超級數據服務器安裝。50TB磁帶庫于2005年6月投入使用。

    科學數據庫系統軟件包括:

操作系統平臺為Windows 2003 Server和Redhat Linux AS 2.1/3;數據庫管理系統有Oracle 9i/10g RAC(2結點8CPU并行),Microsoft SQL Server 2000,MySQL等;機群軟件有聯想機群管理系統、聯想機群監控系統、聯想作業管理系統等;應用軟件有Web服務器Tomcat/apache/Resin/IIS,Java/J2EE,FTP/Rsync等;學科領域軟件有地學GIS軟件(ArcGIS),生物信息處理軟件等。

系統平臺軟硬件環境向科學數據庫建庫單位提供服務,運行良好。結點使用情況為:服務(外部)結點20個,已使用19個;存儲/管理結點9個,全部使用;處理(內部)結點30個,已使用19個。整體結點使用率為79.7%。存儲系統使用情況為:磁盤裸容量20T,RAID容量17T,已分配使用空間14.8T。磁盤陣列使用率為87%。

    數據網格軟件開發與部署

系統平臺的數據網格軟件是針對科學數據庫的特點和需求,利用網格技術,自主開發的一套數據網格中間件和工具集。

以下是最新發布的產品及版本:

· 網格信息服務系統 1.0版

· 通用元數據管理工具 2.0版

· 網格信息與元數據服務(IMS)

· 數據訪問服務(DAS)1.0/1.1/2.0版

· 通用數據訪問工具2.1版

· 科學數據庫CA管理系統 2.0版

· 科學數據庫資源訪問控制工具包1.1版

· 存儲服務1.0版

· 網格門戶

     應用系統

在科學數據庫應用系統方面已經啟動了高能物理領域的“國際宇宙線數據預處理中心”和生物領域的“禽流感等突發疾病綜合信息平臺與預警預報系統”兩個項目。這些應用將在系統平臺軟硬件環境上開發和運行,并充分利用數據網格軟件所提供的支持。禽流感項目由微生物所、武漢病毒所、動物所、網絡中心等4個研究所共同協作完成,在面向e-Science的跨地域、跨學科、跨組織科研協同方面開展了積極的探索和嘗試。

    科學數據庫系統總結

科學數據庫系統平臺的建設過程中,我們還在網格技術等主要技術路線上做了深入的研究,相關研究成果以論文和會議報告的形式發表在國內學術期刊和國內外學術會議上。

在本項目有關工作的基礎上,我們還得到國家有關科技計劃的大力支持:在863計劃中承擔了中國國家網格的應用網格項目“科學數據網格”;在科技部“科學數據共享工程”中承擔了“基礎科學數據中心”項目;在自然科學基金委“以網絡為基礎的科學活動環境”重大研究計劃中承擔了“綜合試驗平臺”的相關課題。

軟硬件環境、系統平臺數據網格軟件都已基本建設開發完成,進入以運行和服務為主的階段,下一步的工作重點是繼續推動建庫單位對系統平臺硬件軟件資源的使用。一方面應加大宣傳推廣力度,讓建庫單位充分了解可用的資源的情況;并提供方便的工具和服務,便于建庫單位使用這些資源。同時,在系統平臺的基礎上進一步推進面向e-Science的科學數據庫應用試點。 

 

 

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