卡巴斯基的反病毒軟件被全球數百萬人使用，但這家俄羅斯最著名的高科技企業存在爭議的歷史事件也非常多。

1. 2015年：前員工稱卡巴斯基涉嫌不當競爭

兩位不愿透露姓名的前雇員稱，卡巴斯基實驗室將Avast、AVG、微軟公司無害的文件標為惡意后上傳到VirusTotal網站，給競爭對手制造誤報。尤金·卡巴斯基駁斥了這項質控，在博客中回嘴稱“心懷不滿的前雇員總是會說前東家的壞話”。

2. 2015年：卡巴斯基遭到民族國家攻擊

在一次戲劇性的新聞發布會上，卡巴斯基發表了聳人聽聞的質控：在一次針對性網絡攻擊中，某民族國家已經通過被稱為Duqu 2.0的軟件攻破了該公司防御。該故事最特別的地方在于，人們通常認為該軟件的前身Duqu 1.0與美國和以色列有關，這讓該指控更加具有爭議性。

3. 2012年：卡巴斯基被指親克林姆林宮

卡巴斯基不只位于俄羅斯，還親克林姆林宮？記者諾亞·夏希特曼是這樣認為的。他在《連線》雜志撰文稱，大量西方國家的企業和消費者使用的卡巴斯基軟件可能和普京政權聯系過于緊密。尤金·卡巴斯基稱，“這只能被歸類為冷戰妄想。真不可能是別的什么了。”

4. 2014：中國政府部門禁止使用卡巴斯基

2014年，《人民日報》宣布，禁止在中國的政府部門使用卡巴斯基和賽門鐵克的軟件。不管其動機在于反對卡巴斯基還是保護本國的軟件公司，這在很多國家都是常見的行為，微軟Windows 8也受到了相同的對待。

5. 2013：尤金 卡巴斯基放棄IPO計劃

目前，科技企業流行IPO，但卡巴斯基離該潮流很遠。據傳擁有公司一半股份的尤金·卡巴斯基宣布停止擬進行的公開募股，還表示計劃回購一年前出售給某風投公司的股份。這是估值的問題還是卡巴斯基已經收購了頤指氣使的股東？

6. 2015：卡巴斯基回應“恐嚇軟件”指控

有指控稱，卡巴斯基公司的軟件依靠虛假信息恐嚇消費者，逼他們購買昂貴的軟件許可證，尤金·卡巴斯基絕不會接受這樣的指控。尤金·卡巴斯基：“他們得到了應有的懲罰，我們狠踢了驢屁股。我最想說的是，別再來找麻煩：我們不是搖錢樹！”。

7. 2012：尤金·卡巴斯基痛恨專利流氓

專利流氓對高科技公司而言是一個敏感話題，但尤金·卡巴斯基則更加直接，他認為專利流氓是縱火犯。卡巴斯基特別不喜歡這些家伙，和他們在法庭上大戰三百回合就是明證。一次知名事件中，卡巴斯基在法庭上擊敗了美國公司IPAT，其它安全公司悄悄放棄，并支付了罰金。尤金·卡巴斯基：“他們不光勒索錢財，還妨礙技術進步！”

8. 2012：尤金·卡巴斯基的兒子在上班路上被綁架

尤金·卡巴斯基20歲的兒子伊凡在上班途中被綁架。綁匪要求交出300萬歐元贖金。四天后，俄羅斯聯邦安全局（FSB）特工在莫斯科郊外的一所房子里找到了這位年輕人。顯然從未有人支付過贖金。

9. 2012年：卡巴斯基實驗室對神秘的Duqu惡意軟件發布研究報告

2011年，人們發現了Duqu木馬，它是一個怪胎，卡巴斯基的研究人員認為它和早期的Stuxnet有所聯系。制作者使用很難辨別的語言編寫它，而且成功隱藏了攻擊的來源。不尋常的是，卡巴斯基讓該國家級惡意軟件成為了一個關乎互聯網未來的政治問題。

10. 2012-2014年：卡巴斯基實驗室揭秘方程小組（Equation Group）、Regin、Darkhotel
 

卡巴斯基對方程小組使用的Flame惡意軟件發布了研究報告。它是迄今為止最復雜的惡意軟件，安全社區在震驚之中發現它簡直屬于未來。卡巴斯基后來又揭秘了幾種類似的惡意軟件，包括可能來源于英國的Regin，以及最近發現被用于監視公司高管的Darkhotel。