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大數據分析揭示卵巢癌治療的新靶點

責任編輯:cres 作者:Riken |來源:企業網D1Net  2024-01-15 15:16:34 原創文章 企業網D1Net

卵巢癌是影響女性生殖系統的最具挑戰性的癌癥之一,其中高級別漿液性卵巢癌(HGSOC)是最致命的。與許多其他類型的癌癥一樣,這種類型的癌癥不是由單一突變驅動的,這使得它更難治療,正因為如此,由理研高級智能項目中心(AIP)和日本國家癌癥中心研究所的Hidnowi Machino領導的研究人員沒有研究DNA序列,而是專注于表觀遺傳學特征——特定細胞類型中影響基因表達的開/關開關,在這種情況下,它會導致腫瘤形成。
 
HGSOC起源于輸卵管,最困難的病例是對化療無反應。研究人員使用來自人輸卵管上皮細胞的細胞瞄準了這種類型的腫瘤,他們在不同的條件下生長,并使用特殊的綜合組學分析進行研究。
 
Machino說:“這項分析集成并分析了來自多種高通量技術的海量數據,包括ATAC、芯片和RNA測序,以獲得對復雜生物系統的整體理解。”
 
這項多組學分析預測,當細胞從正常轉變為癌癥時,控制基因表達的特定因素在腫瘤發生過程中表現異常,這些預測是通過比較正常細胞和癌細胞之間的蛋白質水平來檢驗的。
 
預測成立,研究人員發現,某些蛋白質,即AP-1復合體,在癌細胞中過度活躍,這些蛋白質在刺激癌細胞的生長和擴散方面發揮了作用。此外,另一組蛋白質,GATA家族,通常有助于控制細胞行為,被發現在癌細胞中效果較差。
 
分析還確定了在控制癌癥生長方面發揮關鍵作用的特定基因-MAF、GATA6和DAB2。在腫瘤發生的早期,這些基因在表觀遺傳上受到抑制,導致腫瘤的形成。通過了解抑制這些基因是如何導致功能障礙的,研究人員能夠推斷出一種對策。
 
“我們意識到罪魁禍首是表觀基因抑制導致的RAS過度激活,”Machino說,“并推斷一種可以阻斷這一途徑的藥物將逆轉這一趨勢。”
 
當用曲美替尼進行測試時,他們觀察到了正常表觀遺傳控制的跡象,包括MAF和DAB2的解除抑制。曲美替尼是一種臨床適用的藥物,可以抑制RAS信號。
 
像曲美替尼這樣的藥物被稱為MEK抑制劑,這項研究預測,它們可能在預防卵巢癌的腫瘤形成方面有效。此外,被抑制的MAF、GATA6和DAB2可能是有用的生物標志物。
 
“我們發現的HGSOC生物標記物有可能用于卵巢癌的早期檢測,”Machino說,“這些發現還指出了新的治療方法,這可能會對社會產生重大影響。”
 
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關鍵字:大數據數據分析

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HGSOC起源于輸卵管,最困難的病例是對化療無反應。研究人員使用來自人輸卵管上皮細胞的細胞瞄準了這種類型的腫瘤,他們在不同的條件下生長,并使用特殊的綜合組學分析進行研究。
 
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這項多組學分析預測,當細胞從正常轉變為癌癥時,控制基因表達的特定因素在腫瘤發生過程中表現異常,這些預測是通過比較正常細胞和癌細胞之間的蛋白質水平來檢驗的。
 
預測成立,研究人員發現,某些蛋白質,即AP-1復合體,在癌細胞中過度活躍,這些蛋白質在刺激癌細胞的生長和擴散方面發揮了作用。此外,另一組蛋白質,GATA家族,通常有助于控制細胞行為,被發現在癌細胞中效果較差。
 
分析還確定了在控制癌癥生長方面發揮關鍵作用的特定基因-MAF、GATA6和DAB2。在腫瘤發生的早期,這些基因在表觀遺傳上受到抑制,導致腫瘤的形成。通過了解抑制這些基因是如何導致功能障礙的,研究人員能夠推斷出一種對策。
 
“我們意識到罪魁禍首是表觀基因抑制導致的RAS過度激活,”Machino說,“并推斷一種可以阻斷這一途徑的藥物將逆轉這一趨勢。”
 
當用曲美替尼進行測試時,他們觀察到了正常表觀遺傳控制的跡象,包括MAF和DAB2的解除抑制。曲美替尼是一種臨床適用的藥物,可以抑制RAS信號。
 
像曲美替尼這樣的藥物被稱為MEK抑制劑,這項研究預測,它們可能在預防卵巢癌的腫瘤形成方面有效。此外,被抑制的MAF、GATA6和DAB2可能是有用的生物標志物。
 
“我們發現的HGSOC生物標記物有可能用于卵巢癌的早期檢測,”Machino說,“這些發現還指出了新的治療方法,這可能會對社會產生重大影響。”
 
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